- 2006/10/xx UP 〆切 仮題「重力多体系と専用計算機」
- 2007/11/1 14- 入札説明会 入札室
- 2007/11/1 15- なんか打ち合わせ
- 2007/11/1 17 理研？
- 2007/11/2 10-12 NIFS 会議
- 2007/11/2 15:30 IBM*浜松
- 2007/11/5 10 評価準備なんとか
- 2007/11/15 Springer 〆切。 Springer/9-21 辺り
- 2007/11/16 10-12 NIFS 会議
- 2007/11/20-22 理論部中間発表会
- 2007/11/23,24 高木レクチャー、、、何故私が？
- 2007/11/26 10:00 運用小委員会@総合情報棟2F
- 2007/11/28-29 SS研合同分科会@神戸
- 2007/11/29-30 CfCA UM SS 研で私が話すのは 28 だったはず。
- 2007/12/8 三鷹キャンパス停電
- 2007/12/11 13:30-15:30 NIFS 会議
- 2007/12/20 13:30-15:30 NIFS 会議
- 2007/12/28 学術会議 天文学長期計画シンポジウム
- 2008/1/16 あたり N 体冬の学校
- 2008/1/22? F:SS 14
- 2008/2/5 13-16 総研大中間発表会@大セミナー室
- 2008/2/7-8 理学系天文修士論文発表会・専攻会議
- 2008/2/12 理学系天文専攻会議 13:30 -
- 2008/2/21-23 機構「階層と全体」国際シンポジウム@岡崎
- 2008/x? KITP なんか？
- 月曜 13- 銀河形成ゼミ
- 月曜 17- GDR
- 火曜 10 スタッフ会議、11 理論その他連絡会 (幹事会のあったあとの週)
- 水曜 13:30- 理論部コロキウム
- 木曜 10-12? CfCA 定例
- 木曜 14:40-16:30 駒場藤垣セミナー
- 金曜 午前 総研大セミナー
- 金曜 午後(原則) 研究室セミナー
- 金曜 17-18? 研究室輪読セミナー
- どこ？銀河形成ゼミ
- 2007/10/31 10- 入札説明会 入札室 あれ、専攻会議と、、、
時間調整してもらった。2分くらい説明。 - 2007/10/31 理学系天文専攻専攻会議（学位審査委員など）13:30 -
博士論文審査委員、修士論文査読委員、その他いろんなものを決めるとても重 要な会議。そのあと副台長氏と色々ご相談。 - 3号館周辺はやたら工事中で車がおけない、、、なかなか不便である。
- まだなんか不調。うーん。
2007/10/30
- 2007/10/30 なんか研究会@多分本郷。3体なんとか
- 酒井さんの研究会。うーん、分野が違う人に話をするのって、何を話す のがいいか全然わからない。でもって時間配分も間違えた。うーん。
- GRAPE-6 の写真は実験家な人には大変受けが良いということを発見。
- 風邪引いたかな？
- M林君の日記が笑える。まあ、旧DEC の商売に比べたら、っていうか考え てみるまでもなく同じ会社じゃん。ProLiant だし。
2007/10/29
- なんか記憶がない。本当は振り替え休日。午前中に国際免許更新。
- 明日の準備。
2007/10/28
- 原稿書き
- 2007/10/28 理学部3号館停電
- 本郷にいってマシン立ち上げ
- 明後日の研究会のプログラムを確認しようとしたら、主催の理物某研究 室のマシンがまだ上がってない。1号館の停電は既に終わってると思うが、月 曜朝まで復帰しないのか？
- Google キャッシュによれば私の発表は 10/30 16:15- で 25+5 である。
- 2ch 某所から。
From: [605] 名無しさん＠５周年 <> Date: 2007/10/28(日) 10:44:25 昨日、国立天文台三鷹の特別公開に行って来た。 SX-9を近々導入するらしい。 何テラかは忘れたけど。 ________________________________________ From: [607] 名無しさん＠５周年
まあ、その、要求仕様は 1.6TF だったわけでございます。Date: 2007/10/28(日) 18:28:49 >>605 国立天文台だったらメインはGRAPEだろうから導入しても一桁ノードだろうな。 予算からして8ノードあたりかもね。 ________________________________________ From: [608] 名無しさん＠５周年 Date: 2007/10/28(日) 19:16:27 CRAYとの複合だから8ノードも入らないよ。 ________________________________________ - でもって CJ は CE 募集中と。
- しかし、Cray 本社のページには横浜国大からの受注がでてるのに、 CJ のページにはないのはいかがなものかと、、、
2007/10/27
- 2007/10/27 三鷹特別公開
- 天文台特別公開。私はマニアックな講演をしました。富阪様、小林様、 石山様、その他理論部・CfCA関係者の皆様 どうもありがとうございます。
- 新しいノートに PGPLOT コピーしてなかった。面倒なので再インストー
ル。
110 17:30 apt-get install gcc-g77 112 17:35 cd /usr/local 114 17:35 mkdir pgplot 115 17:35 cd pgplot 116 17:36 copy /home/makino/home2/tmp/pgplot-5.2/drivers.list . 117 17:37 ~/tmp/pgplot/makemake /usr2/makino/tmp/pgplot linux g77_gcc 118 17:37 make 119 17:38 make clean 120 17:38 make cpg 121 17:38 setenv PGPLOT_DIR /usr/local/pgplot/ 122 17:38 setenv PGPLOT_DEV /xwin 123 17:38 copy libpgplot.so /usr/local/lib 128 17:39 vi /etc/ld.so.conf 130 17:39 /sbin/ldconfig 131 17:39 ./pgdemo10
/etc/ld.so.conf に /usr/local/lib を追加。
2007/10/26
- 9時にきてテレビ会議の接続テスト。11/2 用。ふう。
- suspend でこけるのは /etc/hibernate/blacklisted-modules に
ipw3945 2.6.0 2.6.99
とか書いておくと suspend する前にこのモジュールを unload してくれるの で、ちょっと良くなる気が。 - nv デバイスから fbdev にするには一旦 X から抜けたい わけだが、これが上手くいかない。無理矢理 Xを殺すとなんか 変なモードのままコンソールに戻ってしまう。
- 2007/10/26 11 北研2F会議室210
2007/10/25
- SX-9 発表 でた。 1.6 Tflops に対して 4TB/s、 2.5B/F となった。
- 午前中定例。リプレースの実際、、、一杯いろんなことがあることが次 第に明らかに、、、
- 2007/10/25 駒場ゼミあり
既に〆切近い。ご苦労さまです。 - 2007/10/25 17:30 理論セミナー室
某社の営業嬢。 - 2007/10/25 18:30 以降のどこか 何か
とても大変な何か。その後延々と善後策について議論する羽目に、、、
2007/10/24
- 週末に特別公開のなんか、火曜に本郷でなんかレビュー発表、その次の 週からアメリカで、13日に発表、で、12日と15日が〆切のレビュー論文2 本、その週末は SLAC 訪問、11/22かなんか、24, 25, 28 に発表、とかに なってる気が。レビュー論文、、、
- あ、 レビュー論文の1つのエディタはレフェリー回してきた某元 ApJL(だっ け？)氏ではないか。こっち延ばしてもらうかな？しかし、延ばしても 仕事が減るわけでではない。
- 2007/10/24 10 電源関係何か@総合情報棟2F
- いわゆる謎ブログから。
ガートナーの「アナリスト」による何か。
具体的には、IBMのスーパーコンピュータであるBlueGeneと商用のUnixサーバであるSystem pは、製品もアーキテクチャも異なるものであるが、プロセッサの基礎は同じPOWERアーキテクチャである。よってIBMは、BlueGene向けに先行して研究開発したプロセッサおよびシステム技術を、商用サーバであるSystem pに転換することが可能である。
こんな程度の理解でアナリストとかってやってるんだよね、、、、日本の最悪のシナリオは「米国より高い投資を行い、国産ベンダーも競争力が付かず、また利用者にとっても利便性が悪く、かつ限定される。さらに、数年後に再度米国やIBMに抜かれ、その次に、また数千億円もの投資を行う」という循環である。
いや、数年後ならいいんだけとさ。 - 外部ディスプレイだが、でないというか表示が破綻する。で、 nVidia 謹 製ドライバにしてみたら今度は何も出ない。とりあえず、プレゼンテーショ ンの時は fbdev を使うことにして、そのために fbdev の解像度を XGA 程度にしておく。これで画面表示ができることは確認。でも、 fbdev で はせっかくの SXGA+ モードが使えないので、普段は nv ドライバ。
- なんかもうちょっと正しい方法があるんだと思うが、、、
2007/10/23
- 2007/10/23 10 ヒアリング 大セミナー室
- むーん、新しい NA702 で外部ディスプレイに出ない、、、、 Windows (もちろん XP である)では問題なくでるので nv ドライバのせいだよな、、、 せっかくGeForce 7300 が載ってるけど、 fbdev で使うとかすればいいかな？
- 週末から発表が続くので、それまでになんとかしないと。まあ、2台目もっ ていけばいいけど。
- あと、 emacs で色をつかなくしたいんだけど、、、
- C とかには (global-font-lock-mode nil) が有効
- Mew は (setq mew-theme-file "~/lisp/mew-theme.el") にしてここで 何もt定義しなければ OK
- Text モードでも色がつくのはなぜだ？
(setq-default font-lock-auto-fontify nil) (setq-default font-lock-maximum-decoration nil) (global-font-lock-mode nil) (add-hook 'text-mode-hook '(lambda () (font-lock-mode nil) (set-foreground-color "#FFFFFF") (set-background-color "#202030") )) (setq hilit-auto-highlight nil) (set-foreground-color "#FFFFFF") (set-background-color "#202030")と色々やったら一応なんとかなってる。
- 2007/10/23 13 C 総合情報棟 2 F
- 2007/10/23 15 N 総合情報棟 2 F
- 2007/10/23 F:SS あれ、バッティングしてら
- AJ のレフェリー依頼は IOP からくるわけだが、これは Web でなんかす るとメイルがくるというものらしい。で、メイルが SPAM 判定された、、、
-
Subject: Get the fastest runtimes out of your applications From: "Diane XXX"
という、なんか怪しげなスパムみたいなのが Voltaire から来た。 ISR9288 に 4x (SDR) カードつけてポートあたり $450 (ということは 200ポートで 1000万くらいだ)と書いてあるように見える。なんかすごく欲しいぞ。
2007/10/22
- 昨日の数字、 750PB となってた。そんなはずはなくて 750TB である。 指摘どうもです。
- 2007/10/22 午前 理論連絡会
- 午前中に週末ほっておいたメイル処理。連絡会にはでました。
- レフェリー依頼が2日の間に2つきた。しかも一つは元 ApJ(だっけ？)で 今 A&A の何かをやってる某氏からで、あからさまに面倒そうな、、、、
- CPU の速度はともかく実メモリが 3 倍になったためにかなり快適な気 が。 ooffice と mozilla と acroread がそれぞれ数百MBくらい使いたがるし。
- tkppxp が、昨日は正しく /dev/ttyS1 を見にいったのに今日は /dev/ttyS0 を見にいこうとする。なんか設定ファイルが書き変わってるかな？
2007/10/21
- とりあえず文章書いたりメイル読み書きしたりプリンタ使ったりの環境 移行は終了した模様。
- 安藤さんのところからこっちにリンクが。日付もはいったリンクにもできますのでよろしく。
- というのはともかく、次世代が 750TB, 30MW というのは理研の去年の技術調査の時の数字とか ここの 21 ページの表の電力利用料金のところとかに書いてはあります。まあ、これ らが現在でも生きている数字かどうかは不明ですが。
2007/10/20
- ノート PC 環境移行作業。大体出来たような。 pobox とか動く。 ssh-agent がなんか変。 xemacs もなんか変だが、これは emacs のほうを使 うということで。 ローカルな定義は .emacs.my.el に書くと。
2007/10/19
- 2007/10/19 10 CfCA A計画打ち合わせ 総合情報棟2F
予算処理打ち合わせ。 - 2007/10/19 11 天の川なんか
予算処理打ち合わせ。 - 2007/10/19 15 空調調達なんか
なんとか委員会。 - 2007/10/19 16 理論+CfCA 合同連絡会
外部評価なんとか。 - というわけで会議4個+セミナー。なんな疲れた。
- セミナーは石山君、小池君、瀬沼君。
- Y2 壊した(カードスロットを)ので、新しいのをなんか、と思ってたのだ が、CF なんとかはあきたので変なものを、というわけで Epson NA702 を導入。 選択基準は SXGA+ で2kg 前後以下で HDD が容易に交換できるもの。大型バッ テリがあることが望ましい。値段も安いこと。まあ、Celeron にしなかったの でそこそこ高いわけだが、、、
- 40GB ディスクつきで買って、160GB のディスクにまるごとコピーして空 いている 120GB にパーテッション切って Vine 4.1 を入れる。なんか、 suspend とかちゃんと動くので感心する。まあ、最近はそういうものか。ACPI 関係と思われる画面の輝度変更とか出力先切換えも Fn キーでできる。
- 有線 LAN が動かなくてちょっと焦る。 r1000 モジュールを Realtek の サイトにあった r8168 モジュールに入れ替えたら動くようになった。 Realtek の readme に書いてある通り make とかして、 /etc/modprobe.conf と /etc/modprobe.d/blacklist を書き換え(r1000 を r8168 にとか)。
- 無線は intel のドライバいれないと駄目かな？適当なカード入れると認 識するからそれでもとりあえずはいいや。
-
フリーランチのよき時代はもう終わりつつあります。
タンスターフル!(TANSTAAFL)
いや、まあ、その、いってみたかっただけ。
2007/10/18
- 午前 定例。色々
- 午後 記憶なし。
2007/10/17
- 風邪直った。
- 当面の原稿の〆切が、数学会の高木レクチャー(何故私がやるのか依然納 得がいかん)、Springer の何か、ずーっとほってある UT の何か、催促がこな い天文学会の何か、編集から連絡がないもうひとつ別の何かの他にさらにもう ひとつあった気がするんだけど、記録が見つからない。あれ？
- あ、見つかった。 John Wiley のなんかだ。というかこれはパスさせて もらっている。素晴らしい。ということで Springer の何かを。
- その前に論文にコメントをつけて返さないと。遅くてすみません＞関係 各位。
- メモ。横浜市立大学に Cray XT4。4TF, Dual-core, 1.4TBメモリ。
- ここを見ると、
何度かに一度
大好評につき再重版決定! 4次元デジタル宇宙ビューワー収録の書
とでる。大好評だそうです。 - コメントして送る。大体出来ている。素晴らしい。
- AstroGPU 2007。参加者が80人を超えたとか、入りきらないから講演を中 継するとかそういうありえないメイルが、、、
- 2007/10/17 16 総研大懇談・懇親会
諸般の事情でパス。すみません。
2007/10/16
- SWIG が TL8 for x64 (古いか、、、)の機械でインストールできないと
いうのでチェック。
ここにある
make[2]: Entering directory `/home/swig' Build system is out of date. Please reconfigure (rerun: ./autogen.sh && ./configure) make[2]: *** [am--refresh] Error 1 make[2]: Leaving directory `/home/swig' make[1]: *** [../aclocal.m4] Error 2 make[1]: Leaving directory `/home/swig/Source' make: *** [source] Error 2
みたいなエラーがでる。ここにはit is because you have a time-stamping problem, probably because the modification dates of the Swig files were modified when copied from the machine containing a proper operating system to the Windows machine.
と書いてあるけど、だからどうしろと？ am__refresh なるファイルがあるこ とにしたら文句はいわなくなった。別に Windows でなくて Linux でやってる んだけど、、、 - 2007/10/16 15 NC 輪講室
特になにもなし。 - そのあと CfCA 事務室で雑談。テーブル入った。
2007/10/15
- 風邪。不調。
- 2007/10/15 10-11 くらい 来客
- 11:45 くらいだった気が。
- 13 時からも会議。
- 2007/10/15 15 C 総合情報棟2F
- 不調なのでこっちはパス。すみません。
-
Al Geist のどっかでのトーク
- ORNL は Cray Cascade を FY 2011 に
- 6224 ノード、8ソケット、 800,000 コア (ということは 16 コアチップ)
- 20Pflops (ということは 25Gflops/core。 3GHz 8演算なら楽勝かな)
- 1.5PB メモリ
- 15MW
- まあその、 Cascade がどれくらい順調かは知らない、というかこれまで の Cray の実績からは予定通りを想定するのが適当かどうかは難しいけど。
2007/10/14
- 風邪引いたかな？ということで休養日。
2007/10/13
- Excel 2007に乗算のバグが発見されたとのこと。論文書くのに Excel 使っ たら、「シミュレーション結果は正しいんですが表にする時にエラーが発生し まして」みたいな言い訳が使えるかな。しかし、なぜ今更 binary-decimal 変 換のバグなんてものが、、、
- 計算機係の研究会って、やっぱりなぜメイルが×××(ペケではなくて伏字であるということで)であるのかとかを研究する とかそういうのではないのかしら？
2007/10/12
- 10年くらい前に書いた非並列版 treecode について、これの tree 作る
アルゴリズムが 「a little opaque」なんだけど解説とか論文ねーのかこのやろう、み
たいなメイルが某北アイルランド人からくる。書いた返事のメモ:
The tree-traversal part is essentially the same as what is described in Josh's paper for Cyber vectorization, which appeared in JCP in 1988 or so. (or my paper for the use of GRAPE, PASJ 1991?).
このツリーの作り方って誰か論文にしてなかったっけ？ソートすればそれでい い、ってのはほぼ自明だと思うけど、 Warren and Salmon (1993) にはソート するけどその後でやっぱり O(NlogN)でツリー作る無能なアルゴリズムしか書 いてないや。The tree construction part is based essentially on the idea of Hashed Oct tree by Salmon and Warren, which goes back to Josh's original implementation of treecode (I guess still in NEMO), and CM-1 implementation described in the proceedings of IAS supercomputing workshop in 1986. The idea is to make an integer key value for each particle. This key shows the location of that particle within the tree. The key is constructed by shuffling the integer value of x, y, z coordinates.
By sorting the particles using the key, you get Morton-ordered list of particles. Thus, for the top-level eight cells, you can determine the location of a particle by looking at the three most-significant bits (which correspond to the MSBs of x, y and z components). Since the particles are sorted in Morton order, particles which go to the same subcell are in contiguous locations. So you can find the boundary of the subcells by using bisection search. For lower levels you can do the same thing recursively.
This tree construction is very fast, since only the sorting is O(NlogN) and all else are O(N).
- Cosmology の計算だと quick sort 使わないで最初のステップ以降は insertion sort とかのほうが速くなるかもしれないと。ふむ。
- 私の並列版はソート使わないんだけどさ。
- 午前、Milkyway 議論。なんか面白い話になってる気が。適当に文章書きませう。
- 午後セミナー。藤井さん。順調。
- 社長と色々相談。
- 2007/10/12 16 台坂君
- 一橋大学准教授氏、天文台のとても偉い人と論文の中身相談。良い結果 になってると思うのでなんか書いてだしましょう。
- 2007/10/12 17 縣さん
- 4D 相談。色々。
2007/10/11
- CfCA 定例。来年度の利用方針で色々議論。色々温度差はある。もうちょっ と時間かけて調整必要ですね。
- 駒場でセミナーと思ってたら、誰もいない。今日はお休みか？
- アレブログ
。相変わらず味噌も糞も一緒みたいな文章を、、、Capacity Computingっ
てのは要するに安いパソコン並べるだけのもので小さなジョブを大量に流す、
という意味なんだから安いのは当たり前ではないか。で、 4 ソケットノード
を 288 ポートスイッチでつなげられるところ、実際には 144ノードまでを SU
とか称してそれ単位に使うみたいな感じだし。まあ、半分しか使わないんだか
ら288ポートのスイッチ2階層にして全部つなぐこともできるのかな。つないだ
ところで大ノード数でいろんなアプリケーションが走るかどうかはなかなか難
しいけど。
というか、Capacity Computing なのになぜ2階層 IB スイッチ？という のはもちろん疑問で、その辺なんか使えるなら使いたい、というのはあるんだ ろうけど。逆にいえば Capacity Computing と書いておくことで大規模計算が 走らなかった時の言い訳を用意しているわけだ。そういうシステムと、大規模 計算が走るように作ったはずのシステムを比べても、、、
- とはいえ、 T2K と TSUBAME はそういう意味では capacity 志向なので、 同じ枠で比べていい、というのは本当かも。PQ が論外に高い、というのはま あそうだし。
- というわけで久しぶりに 更新してみた。
- 仕様書1つ書いた。次は購入依頼か。
- 社長業のほかに，相変わらず会社と自宅のシステム/ネットワーク管理も担当 しています。 なんか素敵。
- 先週の理研シンポジウムの安藤さんのレポー
ト
次期スパコンの開発状況について、開発チームのリーダーである渡辺氏から報告があったが、設置場所が神戸のポートアイランドに決定したということと、システムは2010年度末に稼動を開始し、2011年度末に完成の工程であり、現在、富士通、日立、日本電気の3社と詳細設計を進めているという程度で、システムの内容については9月14日の「次世代スーパーコンピュータシステムの構成を決定」という発表以上の情報は述べられなかった。
ということでなんかやる気なさげな中身。レポート書いた人が悪いわけではない。
2007/10/10
- 朝から仕様書書き。前に事務からもらったサンプルがどこにあるかしば らく捜した。見つかってから、来年はこういうことがないように、今回作った ファイルにサンプルの場所を書いておこうと思ったら、実は去年書いたファイ ルにサンプルのありかが書いてあった。
- 2007/10/10 15:30- 4D連絡会
- で、午後はコロキウムのあと会議x2。そのあと結構楽しいお話を某君と。
- というわけで仕様書まだできてない、、、
2007/10/9
- なんか計算機系の研究会の program committee をやってとかいうメイル が。時間があれば受けるけどとてもとても無理なので断る。すみません。 場所がイスキアというのがちょっと魅力ではあったが。
- 2007/10/9 10:30 日経取材
天文台の新システムの取材と、次世代の噂話。あとのほうが長かった気が。 - 2007/10/9 15 N
バッチキューをどうするかとか。 - 2ch から:
泰地真弘人氏がプロジェクト副ディレクターを務めているGSCシステム情報生物学 研究グループは、先端情報科学研究領域に改組になり、FRと中央研究所が合さって 発足する基幹研究所に所属します。
へえ。
2007/10/8
- 作業続き。発送した。
2007/10/7
- 集録原稿書き、というか別原稿を半分につめる作業。
2007/10/6
- 休養日
- 「数理科 学誌のY&M」って、あの記事は(文体その他全部)船渡さんのである。私は あーゆー文体では書かないということを強く主張したい。
2007/10/5
- セミナー、小南さん、谷川君、似鳥君。
- 阿部さん来訪。ソニーの1Uな何かの話。
2007/10/4
- CfCA 定例。色々。
- 2007/10/4 11 教授会。少し早めにいくこと。
いった。浜松の人が感謝状を貰うのの見物。 - プログラム委員会。まあ無難に。
- そのあと何をしてたっけ？集録原稿書きが進んでない、、、
2007/10/3
- 2007/10/3 10 ネットワーク委員会 小会議室
- 2007/10/3 13:30 Cray 理論セミナー室。あ、、、コロキウム忘れてた。
色々聞く。 - 2007/10/3 14:30 理論連絡会
これもパス。すみません。 - 2007/10/3 16 IBM
色々 - なんか会議と打ち合わせだけで時間がすぎてく、、、、
2007/10/2
- 天文データセンター研究支援員公募 10/9 〆切だそうです。
- 2007/10/2 13 MUV 移転打ち合わせ 輪講室だったと思う
輪講室であった。 - 2007/10/2 15 N/C 打ち合わせ
Nの人数に驚く。昔駒場でFとなんかした時もこれくらい来たかな。 - このあと本郷で打ち合わせ。浅野キャンパスが面倒なことに、、、
- メイル受ける経路を変えたので、 SPAM フィルタの認識率が現在ちょっ と下がっている (95%くらい)。まあ、もうちょっとで回復すると思うけど。で、 SPAM なメイルを見ていると、先月の初めから、日付が 8/32 とか 8/33 とかいうものが発生するようになっていて、今月もそういう の (9/33 とか)があるんだけど、これは何のバグなんだろう？
- メイル配送が1時間くらい遅れてる気が。そういえば明日はネットワーク 委員会だ。
2007/10/1
- 782645
- 重役出勤する。昨日寝たの4時だし。
- これまで10年以上メイルは大学のマシンに置いていたので、いきなりロー カルのマシンにくるのは何かまだ違和感がある。
- 高校の同級生の 小林君からめちゃくちゃ不吉なメイルが、、、